Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBF4Q9BQW3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBF4Q9BQW3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms