Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL13Q99616 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL13Q99616 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms