Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms