Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SAMD8Q96LT4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SAMD8Q96LT4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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