Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms