Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms