Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CELF6Q96J87 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CELF6Q96J87 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms