Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHDQ96IW2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHDQ96IW2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms