Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms