Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PYDC1Q8WXC3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms