Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSKUQ8WUA8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms