Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC9Q8TBE3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms