Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AVL9Q8NBF6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms