Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL3Q8N8U3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms