Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIX1LQ8IVB5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms