Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00523Q86TU6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms