Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4F1

LRP10, Low-density lipoprotein receptor-related protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP10Q7Z4F1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP10Q7Z4F1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP10Q7Z4F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms