Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC16A9Q7RTY1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC16A9Q7RTY1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC16A9Q7RTY1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms