Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms