Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEND4Q6ZU67 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms