Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA0408Q6ZU52 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms