Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms