Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINGO4Q6UY18 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms