Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms