Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms