Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms