Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BOLA3Q53S33 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BOLA3Q53S33 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms