Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF3Q3KNV8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms