Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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