Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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FOXD1Q16676 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
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FOXD1Q16676 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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FOXD1Q16676 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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FOXD1Q16676 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
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FOXD1Q16676 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD1Q16676 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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