Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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