Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK4Q16099 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms