Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIP13Q15645 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms