Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms