Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms