Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SCARB2Q14108 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SCARB2Q14108 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SCARB2Q14108 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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