Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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