Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-12■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.924e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NLK-202ENST00000496808 1702 ntTSL 26.18□□□□□ -1.424e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TPT1-210ENST00000529421 801 ntTSL 37.41□□□□□ -1.222e-13■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 324.38■■□□□ 1.494e-11■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 223.89■■□□□ 1.414e-11■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ACBD6-205ENST00000496993 672 ntTSL 57.95□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FAM3A-221ENST00000612856 3995 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-7■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 318.11■□□□□ 0.496e-10■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ADRM1-202ENST00000462554 735 ntTSL 330.84■■■□□ 2.531e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.471e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.421e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.171e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.141e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-209ENST00000597589 1682 ntTSL 527.44■■□□□ 1.981e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ZBTB7B-206ENST00000487542 873 ntTSL 227.24■■□□□ 1.951e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.941e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-213ENST00000566631 1633 ntTSL 226.7■■□□□ 1.861e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FUNDC2-205ENST00000484175 666 ntTSL 326.36■■□□□ 1.811e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.81e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.651e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.561e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ALG3-204ENST00000423996 904 ntTSL 224.76■■□□□ 1.551e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TMEM54-204ENST00000474144 748 ntTSL 324.02■■□□□ 1.441e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ALG3-214ENST00000488976 910 ntTSL 223.94■■□□□ 1.421e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ZBTB7B-204ENST00000461530 658 ntTSL 423.86■■□□□ 1.411e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RAD51D-213ENST00000587977 1732 ntTSL 223.76■■□□□ 1.391e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-212ENST00000599019 1703 ntTSL 523.42■■□□□ 1.341e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-214ENST00000567472 841 ntTSL 323.37■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-207ENST00000564818 1653 ntTSL 1 (best)23.25■■□□□ 1.311e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.311e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ALG3-208ENST00000461415 1017 ntTSL 223.08■■□□□ 1.291e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 DCUN1D5-205ENST00000527779 842 ntTSL 222.7■■□□□ 1.221e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-206ENST00000563493 1651 ntTSL 522.52■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-205ENST00000562058 1876 ntTSL 1 (best)22.46■■□□□ 1.191e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.151e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ALG3-212ENST00000482048 725 ntTSL 1 (best)22.16■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ELOVL1-207ENST00000470968 867 ntTSL 521.54■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.039e-18■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 MBD3-210ENST00000592361 907 ntTSL 520.84■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 320.54■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ALG3-203ENST00000414845 814 ntTSL 520.53■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 320.34■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-211ENST00000565881 1565 ntTSL 520.14■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NFIC-208ENST00000589537 977 ntTSL 220.11■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AC004223.3-202ENST00000591723 676 ntTSL 520.01■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-215ENST00000568210 1717 ntTSL 220.01■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-216ENST00000568273 1711 ntTSL 219.99■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 DUS2-203ENST00000561965 1712 ntTSL 519.84■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 519.64■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RAD51D-209ENST00000586044 1571 ntTSL 1 (best)19.1■□□□□ 0.651e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ELOVL1-203ENST00000464204 1034 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ADRM1-203ENST00000465805 630 ntTSL 218.41■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RAD51D-216ENST00000588594 1409 ntTSL 218.24■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AC004223.3-203ENST00000592181 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.94■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 317.81■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 POP7-202ENST00000457480 483 ntTSL 317.47■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 FNTA-205ENST00000526755 4676 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-210ENST00000567998 7948 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.29e-18■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ULK3-219ENST00000568718 707 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-208ENST00000597390 1367 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 PRKD2-217ENST00000602155 1043 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TMEM54-206ENST00000482771 569 ntTSL 215.85■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.026e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.086e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TIMM50-205ENST00000595527 2274 nt14.46□□□□□ -0.091e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 ALG3-211ENST00000477959 538 ntTSL 414.36□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 NSMCE1-209ENST00000565384 580 ntTSL 314.27□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.156e-8■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 TIMM50-214ENST00000600878 773 ntTSL 313.98□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 16.1
PABPC4Q13310 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 16.1
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