Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA1Q13131 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKAA1Q13131 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms