Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLFQ13129 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLFQ13129 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLFQ13129 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms