Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACACAQ13085 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms