Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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