Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRJQ12913 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRJQ12913 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms