Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms