Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms