Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC42EP1Q00587 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms