Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms