Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63132 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms