Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms