Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB25P57735 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms